Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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PKP1Q13835 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PKP1Q13835 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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