Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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