Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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