Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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MKRN4PQ13434 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MKRN4PQ13434 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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