Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms