Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CBX3Q13185 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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