Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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RPA4Q13156 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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RPA4Q13156 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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RPA4Q13156 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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RPA4Q13156 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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RPA4Q13156 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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RPA4Q13156 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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