Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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