Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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