Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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FOXD4Q12950 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD4Q12950 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD4Q12950 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD4Q12950 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD4Q12950 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXD4Q12950 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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