Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF2Q12933 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms