Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms