Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATRXP46100 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATRXP46100 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATRXP46100 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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