Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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CASQ1P31415 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
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CASQ1P31415 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CASQ1P31415 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CASQ1P31415 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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CASQ1P31415 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CASQ1P31415 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CASQ1P31415 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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CASQ1P31415 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CASQ1P31415 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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