Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPG7Q9UQ90 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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