Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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