Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FAM53CQ9NYF3 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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FAM53CQ9NYF3 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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FAM53CQ9NYF3 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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FAM53CQ9NYF3 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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