Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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