Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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