Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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CCDC47Q96A33 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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CCDC47Q96A33 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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CCDC47Q96A33 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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CCDC47Q96A33 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CCDC47Q96A33 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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