Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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