Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms