Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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