Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms