Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL19A1Q14993 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms