Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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