Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MDC1Q14676 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MDC1Q14676 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms