Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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