Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPTAN1Q13813 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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