Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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ATP1A4Q13733 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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ATP1A4Q13733 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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