Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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