Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms