Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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GRIN2BQ13224 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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GRIN2BQ13224 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GRIN2BQ13224 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
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GRIN2BQ13224 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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GRIN2BQ13224 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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