Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CSTF3Q12996 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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