Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFX1Q12986 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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