Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms