Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SH3BP4Q9P0V3 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4Q9P0V3 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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