Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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GGA3Q9NZ52 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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GGA3Q9NZ52 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GGA3Q9NZ52 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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