Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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