Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CRELD1Q96HD1 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms