Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGGTAQ92696 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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RABGGTAQ92696 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGGTAQ92696 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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