Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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