Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CLDN19Q8N6F1 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms