Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms