Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms