Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNAPC1Q16533 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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