Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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