Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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ALX1Q15699 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ALX1Q15699 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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ALX1Q15699 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ALX1Q15699 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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