Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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