Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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BRD3Q15059 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRD3Q15059 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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